
Nach dem Studium der Humanmedizin und Promotion in München arbeitete Dr. Quak mehrere Jahre als Assistenzarzt bei Dr. med. Michael Barthel, dem Sohn von Dr. Horst Barthel (Synthetisches Repertorium) und Schüler von Dr. Jost Künzli von Fimmelsberg (Repertorium Generale). Seine homöopathischen Lehrer und Meister sind und waren Dr. Arthur Braun, Dr. Michael Barthel, Dr. Horst Barthel und Dr. Dario Spinedi. George Vithoulkas prägte ihn ebenfalls sehr. Dessen Bücher öffneten ihm neue Perspektiven, im persönlichen Kontakt ist George Vithoulkas ein faszinierender Mensch und Homöopath.
Seit 1997 ist Dr. Quak als homöopathischer Arzt selbstständig niedergelassen. Zunächst in einer kleinen Gemeinschaftspraxis, später als Geschäftsführer eines homöopathischen Praxiszentrums in München. Seit 2009 in Fürstenfeldbruck.
Die Praxis entwickelte sich von 1997 bis 2009 zu einer der größten privaten Homöopathiepraxen in Deutschland. Dazu beigetragen haben neben der beruflichen Tätigkeit Dr. Quaks, wohl auch sein Engagement für die Ausbildung junger Studenten und Kollegen im Rahmen seiner ärztlichen Weiterbildungermächtigung für Homöopathie, aber auch für den Deutschen Zentralverein homöoopathischer Ärzte und als Lehrer im Augsburger Dreimonatskurs. Als mehrjähriger Vorstand der Hahnemanngesellschaft engagierte Dr. Quak sich auch berufspolitisch für die Homöopathie.
Wichtige Buchprojekte waren für ihn die Herausgabe der „Praktischen Materia Medica“ und der „Leitfaden Homöopathie“, der heute ein Standardwerk der homöopathischen Ausbildungsliteratur ist.
2009 gründete er mit seiner Frau und homöpathischen Ärztin Katrin Quak die Gemeinschaftspraxis Dr. Thomas und Katrin Quak in Fürstenfeldbruck, in der er bis heute tätig ist. Neben der umfassenden Praxistätigkeit engagierte er sich in Fürstenfeldbruck für die Aus- und Weiterbildung homöopathischer Ärztinnen und Ärzte. Die kleine „homöopathische Akademie für Postgraduiertenausbildung“ (HAPA) veranstaltete bis 2019 regelmäßig die Weiterbildungsveranstaltungen „Homöopathische Fragestunde“ und „Homöopathische Supervision“. Für Laien wurden pro Jahr bis zu acht Vortragsveranstaltungen mit assozierten homöopathischen Ärzten und Psychotherapeuten angeboten. 2017 gründete Dr. Quak das Institut für homöopathische und naturmedizinische Forschung jaqu-invent. Im April 2020 startete Dr. Quak die gemeinnützige Gesellschaft „Medsyne“ , mit der Aufgabe, wissenschaftliche Forschung in der Homöopathie und der integrativen Medizin zu fördern.
Zusammen mit seiner Frau Katrin hat Dr. Quak fünf Töchter und vier Enkelkinder.